A Escola Básica do 2º e 3º ciclos Dr. Fortunato de Almeida teve a sua génese na década de 70, nomeadamente no ano lectivo de 1972/1973. Começou por ser uma escola preparatória com a denominação General José da Cunha Cabral e funcionava numa antiga casa de habitação na rua das Morgadas, em Nelas.

No ano lectivo de 1984/1985, deixou a rua das Morgadas para se instalar no largo Dr. Veiga Simão, e a partir do ano lectivo de 1996/1997 verifica-se nova mudança de instalações, começaram a ser utilizadas as actuais instalações, construídas de raiz e situadas na avenida Dr. Fortunato de Almeida, também em Nelas, passando a ter a estrutura de funcionamento Escola Básica do 2º e 3º Ciclos (2º e 3º CEB), com uma frequência média de 320 alunos.